El pronóstico depende del estadio evolutivo en que se diagnostique el tumor, de la capacidad funcional del hígado sobre el que se asienta y de la posibilidad de aplicar tratamiento radical.
En estudios pasados, las series antiguas con una mayoría de pacientes en fase avanzada describían una supervivencia media inferior a cuatro meses, esta expectativa se observa en pacientes con fallo hepático correspondiente al estadio Child. Pugh C y/o con tumores extensos asociados a síndrome constitucional y postración superior al 50% del tiempo diurno (performans status mayor a dos).
Por el contrario, en pacientes asintomáticos con tumores detectados en fase inicial (nódulos únicos o hasta un máximo de tres nódulo m<3 cm) la aplicación de tratamiento permite superar el 70% de supervivencia a los 5 años.
Por último, en los pacientes con tumores de gran tamaño o multinodulares (fase intermedia) la supervivencia a los tres años oscila entre el 20 % y el 50% respectivamente incluso sin aplicar tratamiento.