En la enfermedad superficial el tratamiento de elección es la resección transuretral (RTU) de todas las lesiones visibles, seguida o no de la administración intracavitaria de quimioterapia o de bacilo de Calmette-Guérin (BCG), según sea la valoración individual del riesgo de progresión del tumor en cada paciente. La administración de BCG reduce la tasa de recaídas y aumenta el período libre de enfermedad, bien por efecto inmunológico o por un componente de citotoxicidad directa. El porcentaje de curaciones de estos tumores se aproxima al 80% y su seguimiento se realiza mediante citoscopias periódicas. En tumores en estadio invasivo el tratamiento quirúrgico consiste en la cistectomía simple o radical precedida o no de radio o quimioterapia y seguida igualmente de quimio o radioterapia. La derivación urinaria más frecuentemente adoptada es la ureteroileostomía, aunque cada vez se tiende más a la formación de una neovejiga a expensas de un asa desfuncionalizada de intestino. La tasa de supervivencia a los 5 años se aproxima al 50%.
En fase de metástasis se utilizan diferentes regímenes de quimioterapia compleja pero el tratamiento es eminentemente paliativo. Las tasas de supervivencia no superan el 30%.